在整体组织或器官层面开展蛋白质组学研究，可以获取复杂的生物功能信息。然而，组织内部通常包含大量不同类型的细胞，这些细胞分布于不同的解剖区域，并显示出显著的异质性。传统的蛋白质组分析方法难免会出现平均化效应，同时伴随着大量空间信息的损失。

随着单细胞组学技术的迅猛发展，研究人员现在能够在单细胞层面深入探索遗传学、转录组学、表观遗传学和蛋白质组学。然而，单细胞技术通常会剥离细胞的原位环境，从而牺牲了重要的空间信息，这使得我们在解析组织异质性等问题时面临挑战。这时，空间组学应运而生——能够精确识别不同区域位置，并解析组织细胞的复杂性。2022年，空间多组学被南宫28品牌在Nature杂志列为最值得关注的七项技术之一。

空间转录组学使我们能够从基因表达层面揭示不同组织和细胞的基因表达差异。然而，转录组与蛋白质之间的相关性通常较低，而蛋白质是细胞生物功能的实际执行者。因此，靶组织内部的空间异质性对基于蛋白质的药物治疗至关重要，准确量化这种空间分布有助于揭示治疗成功与否的机制，并为直接治疗和工程干预提供理论支持。因此，进行单细胞或单细胞核分辨率的空间蛋白质组学分析显得尤为重要。

最近，空间蛋白质组学（spatial proteomics）荣膺南宫28品牌由Nature Methods评选为2024年度技术，突出其在揭示生物复杂性、促进精准医学和癌症研究中的革命性贡献。西湖欧米的FAXP™产品，结合了基于水凝胶的组织膨胀、滤膜辅助样本制备流程和高分辨率Orbitrap Astral质谱，使研究者能够在组织水平下进行单细胞和亚细胞器分辨率的空间蛋白质表达分析。

福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织是病理组织存储和分析的标准，全球数以亿计的FFPE组织存储于生物样本库中。因此，FFPE样本的检测分析能力大大扩展了空间组学技术在临床问题中的应用范围。FAXP™是适用于临床FFPE样本的空间蛋白质组学分析的稳健工作流程，具有85倍的分析速度提升和255%的蛋白质鉴定数量提升。在亚细胞器的蛋白质组学分析中，FAXP™产品与激光捕获显微切割技术（LCM）相结合，展现出独特的优势。

FAXP™产品特色包括：1）均一性——FFPE样本等比例膨胀；2）高灵敏度、高鉴定量、高分辨率——在DDA和DIA模式下的tip内酶解均优于胶内酶解，尤其在小于3054 nL的组织样本中效果显著；3）高通量，通过优化的样本处理流程，整体处理时间比ProteomEx™节省53%；4）高分辨率，结合LCM技术实现单细胞与亚细胞水平的空间蛋白质组学分析。

我们利用FAXP™探索结直肠癌患者组织内的异质性，在同一切片上对正常组织、低级别异型增生、高级别异型增生和癌组织进行了比较分析。此外，我们通过热图评估不同疾病区域、质谱批次、患者样本的变异性，结果显示不同批次和患者间的蛋白鉴定具有良好的一致性，从而验证了南宫28品牌FAXP™工作流程的重复性和可靠性。

随着南宫28及其FAXP™产品的推出，科研人员在高分辨率空间蛋白组学分析领域拥有了更强大的工具，欢迎广大研究者垂询获取相关科研服务及商业化试剂盒。